Библиотека КГМА им. И.К.Ахунбаева была основана в 1939 году. 

У истоков создания библиотеки, основой для которой была база библиотеки Дома врача, стояли Л.М.Лаппа-Данилевская, Н.А.Рутковская, В.Р.Гончарова, С.М.Бокинг и др. На тот момент фонд библиотеки насчитывал 11936 книг, брошюр и журналов.

В течение 30-лет руководителем была Зоя Кадыровна Мустаева, которая внесла огромный вклад в развитие библиотеки.

С 1989 года библиотекой руководила Гончарова  В.Р.

В 2002 году библиотекой заведовала Мырзабекова С.Дж.

В 2005 году  в медакадемии была создана электронная библиотека.

С 2007 года библиотекой руководила опытный специалист  библиотечного дела Сулайманкулова Б.Н., стаж работы в библиотеке 45 лет. Сулайманкулова Б.Н. была удостоена звания «Отличник образования КР». По инициативе Сулайманкуловой Б.Н. в целях улучшения обслуживания читателей в 2009 году по решению комиссии КГМА электронная библиотека была передана в ведение библиотеки.

С 2009 года заведующей библиотекой была назначена Иманкулова Дж.Дж.

В 2010 году был создан Информационно-Библиотечный Комплекс (ИБК) во главе  с Карашевой Н.Т., в структуру которого вошли  библиотека, электронная библиотека, отдел системного и технического обеспечения и сектор технических средств обучения.

В 2014 году в  библиотеке был установлен ИРБИС-64, который позволил автоматизировать работу по каталогизации.

В 2015 году для более  полного обеспечения доступа к электронным ресурсам  пользователей библиотеки КГМА им. И.К. Ахунбаева был  создан  собственный официальный  сайт библиотеки library.kgma.kg. На сайте размещается информация о новых поступлениях печатных изданий. Сайт библиотеки предоставляет возможность удаленного  доступа к полнотекстовым базам  учебников, учебно-методических материалов.

С 2016 года в связи с реорганизацией ИБК, библиотека стала самостоятельным структурным подразделением, в которую вошла электронная библиотека.

С 2017 года заведующей библиотекой была назначена Ибраимова Г.

В 2017 году был открыт читальный зал в морфокорпусе.

В 2018 году в студенческом кампусе им. И.К.Акылбекова с.Таш-Дөбө были открыты библиотека и читальный зал для  читателей лечебного факультета  с английским языком обучения.

В 2019 году открылась электронная библиотека в морфокорпусе.

В 2021 году был открыт новый читальный зал в морфокорпусе.

     В настоящее время фонд библиотеки насчитывает более 620 тыс. экз. различных документов, из которых большинство составляют медицинские учебники.

Фонд электронной библиотеки составляет более 7000 учебников, учебно-методических материалов, видеоматериалов. В библиотеке  для студентов имеются электронные книги.

Фонд периодических изданий составляет 78 наименований научно-медицинских журналов. Ежегодно для преподавателей и студентов осуществляется подписка на научные медицинские журналы и газеты.

Для студентов - бенефициаров имеются учебники  по системе Брайля. Для преобразования произведения в экземпляр доступного формата для бенефициаров установлена программа “Балаболка”.

В библиотеке обслуживание читателей осуществляется на 7-и абонементах,  в 7-и читальных залах на 278 посадочных мест в главном корпусе, в стомцентре, в морфокорпусе,  в 4-м учебном корпусе, в студенческом кампусе им. И.К.Акылбекова, в 3-х залах электронных ресурсов на 39 посадочных мест. Ежегодно библиотечные работники обслуживают более  215 тыс.  пользователей и выдают  более 360 тыс. различных видов изданий.

Электронная библиотека формирует электронные ресурсы по вопросам медицины и здравоохранения. Доступ к ресурсам имеют читатели медицинской академии в режиме аудиторного чтения. В электронной библиотеке имеется доступ к медицинским базам данных  сети Интернет.

Электронная библиотека содержит следующие ресурсы:

• книги в электронном формате
• учебно-методические материалы
• лекции
• медицинские видеоматериалы
• аудиокниги
• Полнотекстовая база журнала «Вестник КГМА им.И.К.Ахунбаева»

Сотрудники библиотеки ежегодно проводят книжные выставки.

В библиотеке автоматизированная библиотечная система «ИРБИС». На данный момент установлены модули: «АДМИНИСТРАТОР», «КОМПЛЕКТАТОР», «КАТАЛОГИЗАТОР», «ЧИТАТЕЛЬ», «КНИГОВЫДАЧА».

Для более  полного обеспечения доступа к электронным ресурсам  пользователей библиотеки КГМА им. И.К. Ахунбаева был  создан собственный официальный  сайт библиотеки library.kgma.kg

На сайте размещается информация о новых поступлениях печатных изданий.

Сайт библиотеки предоставляет возможность удаленного  доступа к полнотекстовым базам  учебников, учебно-методических материалов.

Доступ возможен через логин и пароль:

Логин    - Фамилия читателя

Пароль  - № читательского билета

Запущен сайт журнала “Вестник КГМА” vestnik.kgma.kg 

1. Библиотека

• Комплектование и организация каталогов
• Абонемент обслуживания студентов старших курсов, клинических ординаторов, аспирантов и ППС 
• Абонемент обслуживания читателей лечебного факультета  с английским языком обучения в главном корпусе
• Абонемент обслуживания читателей лечебного факультета  с английским языком обучения в студенческом кампусе им. И.К.Акылбекова
• Абонемент обслуживания читателей в морфологическом корпусе
• Абонемент обслуживания читателей стоматологического факультета
• Абонемент обслуживания читателей фармацевтического факультета
• Абонемент обслуживания читателей общеобразовательных дисциплин, лицея и подготовительного курса
• Читальный зал в главном корпусе
• Читальный зал научно-медицинской информации    
• Читальный зал для читателей лечебного факультета с английским языком обучения в главном корпусе
• Читальный зал для читателей лечебного факультета с английским языком обучения в студенческом кампусе им. И.К.Акылбекова
• Читальный зал в морфологическом корпусе
• Читальный зал в стоматологическом центре
• Читальный зал в 4-м учебном корпусе

    2. Электронная  библиотека

• Зал электронных ресурсов в главном корпусе
• Зал электронных ресурсов в морфологическом корпусе