Кафедра «Общей гигиены» была организована в 1941 году. Первым заведующим кафедрой был назначен д.м.н., профессор Малышев Владимир Петрович, занимавший до этого должность руководителя санитарно-гигиенического отдела санитарно-бактериологического института. 

В 1942 г. кафедру возглавил д.м.н., профессор Берестечко Лев Ефимович, давший глубокое развитие гигиенической науки в республике. В 1945 г. Лев Ефимович был назначен деканом санитарно-гигиенического факультета и кафедру возглавил профессор Феликс Станиславович Околов известный научными работами по гигиене питания и успешно развивавший данное направление гигиенических исследований.

В 1956 г. кафедру возглавлял д.м.н., профессор Гудзовский Георгий Александрович. С 1959 г. по 1962 г. кафедрой заведовал к.м.н. Бойко А.А.

Необходимо отметить высокую продуктивность научно-педагогической работы кафедры в данный период. Большое внимание он уделялось воспитанию молодых специалистов. Аспиранты и докторанты кафедры выполняли ряд крупных научных исследований по различным направлениям гигиены. Результаты научных исследований были успешно завершены в виде ряда докторских и кандидатских диссертаций и отмечены высокими правительственными наградами. Будущий д.м.н., профессор Перелыгин Вениамин Михайлович, подготовив на кафедре «Общей гигиены» диссертационную работу по вопросам санитарно-гигиенической характеристики сахарных заводов Киргизии, возглавил единственный на тот момент научно исследовательский институт министерства здравоохранения - КНИИ эпидемиологии, микробиологии и гигиены.

Сложившийся в течение десятилетий научно-педагогический потенциал позволил кафедре успешно развиваться в последующие годы.

Кафедру возглавляли: д.м.н., профессор Рыспаев Сапар Рыспаевич (1962 - 1978гг.); лауреат Государственной премии, д.м.н., профессор Мамбеталиев Будин Сооронбаевич (1978 - 1998гг.); лауреат Государственной премии, д.м.н., профессор Касымов Омор Тилегенович (1998 – 2005гг.).

В настоящее время кафедру возглавляет к.м.н., доцент Джорбаева Айна Асановна.