В 1946 году  Главным  бухгалтером была назначена  М.П.Берсина, которая проработала до 1952 г.

С 1980г. главным бухгалтером  академии работали: В.И.Василенко,  П.А.Деревянко,  С.П.Морозова, Б.С.Мамытова. Начальником планово-экономического отдела с 1980г. работала А.А.Чиж,  затем  В.И.Семенихина, а с 2003г.-Н.П.Иванова.

В 2007 г. было образовано управление Финансово-экономической деятельности и материального обеспечения. В состав управления входили 3 сектора: сектор экономики и финансов, сектор учета и отчетности, сектор материального обеспечения . С 2007 года Начальником управления работали С.Т.Джолбунова,  А.Э.Атакеева,  Б.М.Казиева .

В 2017 году был образован Отдел Финансово-Экономической работы и Бухгалтерского Учета

с численностью  15 человек.  В отдел входит расчетная бухгалтерия, материальная бухгалтерия и  сектор финансово-экономической работы.

Начальником отдела с 05.01.2017 года работает  Тиленчиев  Асанбек  Рысалиевич Зам.начальника  ОФЭР и БУ Лопатина Д.Ю. 

Отдел финансово-экономической работы и бухгалтерского отчета (ОФЭР и БУ) является структурным подразделением КГМА, основной задачей которого является прогнозирование и организация финансово-экономической деятельности  медакадемии,  ведение бухгалтерского учета и отчетности с учетом специфики КГМА как образовательной организации.