КГМА им. И.К. Ахунбаева является членом следующих внутристрановых региональных ассоциаций

Ассоциация высших учебных заведений Кыргызстана		Договор о создании Ассоциации ВУЗов Кыргызстана
Ассоциация медицинского образования в Кыргызской Республике		Меморандум о создании Ассоциации медицинского образования в Кыргызской Республике